Na Enciclopédia das Ciências Filosóficas encontra-se a noção de Ideia, importante elemento do sistema hegeliano, pois perpassa o processo do pensar e do pensável, estrutura todo o sistema. Hegel cuida da ideia, principlamente, nas obras: Ciência da Lógica e Enciclopédia das Ciências Filosóficas. E na Enciclopédia das Ciências Filosóficas observa-se divisão tripartida de seu conteúdo: Lógica, Filosofia da Natureza e Filosofia do Espírito. Nela se impõe o todo, o movimento do pensamento, que é unidade da unificação, mas também da diferenciação. Trata-se automovimento a partir do qual se depura, por exemplo, o conceito. Mas a Enciclopédia das Ciências Filosóficas diferencia-se das demais enciclopédias, ao identificar nelas o saber inicial, os primeiros conceitos de ciências particulares ordenadas de forma isolada, sem a constituição de um saber absoluto ou total, tal qual se observa naquela.  Em seu interior é possível verificar três grandes momentos da Ideia no seu mover: a Lógica, a Filosofia da Natureza e a Filosofia do Espírito e desdobramento deles em outros três, logo, nove partes, e ao final doze, ao total, que não são estanques ou imóveis, mas sim em um completo integrar-se para formar o todo en-ciclo-pédico. A Lógica expõe a Ideia em seu momento de identidade, daquilo que ela, essencialmente, é, articulando-se, também, em três momentos: identidade universal; diferença universal; e identidade universal da identidade e da diferença. Na Filosofia da Natureza a Ideia aliena-se, apresenta-se como exterioridade de si mesma e, ainda, como natureza dividida em três momentos: mecânica, exterioridade abstrata; o espaço e o tempo. Na Filosofia do Espírito o movimento da Ideia, tem-se a formação do Espírito, a natureza que simplesmente é, a contradição de si, e incapaz de vencer a força dos opostos que nela estão contidos, a ideia é junto de si, para si. Distingue-se em: Espírito Subjetivo, Espírito Objetivo e Espírito Absoluto. A Enciclopédia é o saber que se diversifica na particularidade sem perder a unidade e a totalidade.